使用完噴霧干燥機，需要定期進行清潔維護工作，以延長機器使用壽命，確保機器能夠正常使用。清潔方法可根據實際選擇用于干洗、濕洗或化學洗滌。在干洗過程中，可用刷子、真空吸塵器進行有效清洗，濕洗：用60~80°C的熱水清洗。清潔步驟如下：
  1）提取機組：設備在線清潔
  1.檢查機器出料口能否有剩余藥粉，如有則用尼龍刷子打掃潔凈。
  2.可拆卸部位的清洗將可拆卸部位保送藥液軟管卸下送至工用具清洗室，用高壓水槍重復沖洗保送藥液軟管至干凈后再用純化水沖洗一遍，取干燥擦布擦抹保送藥液軟管表面至無水跡為止。
  2）噴霧干燥機主機的清洗
  1.用高壓水槍沖洗干燥機筒體內外及輸料管道表面、旋風別離器及攪拌罐內外。
  注:關于難清潔的部位可用2%NaOH溶液沖洗或擦拭。清洗潔凈后，取不銹鋼桶放到出料口下面，翻開干燥機筒體底部出料口雙蝶閥，把清洗后污水放出后倒掉。
  2.將收粉管道上部清洗口打開，再翻開旋風別離器雙蝶閥的上、下閥門，再將不銹鋼桶放于雙蝶閥下，將高壓水槍軟清洗噴頭由清洗口外側導入，啟動高壓水槍，來回拉動清洗噴頭，沖洗收粉管道及旋風別離器雙蝶閥，直至流出水PH值為中性并廓清為止。
  3.取尼龍刷子由攪拌罐底部放料閥外側引入，來回刷數次，邊刷邊用水沖洗，難清潔的部位可蘸取2%NaOH溶液刷洗，最后沖洗至流出水PH值為中性并廓清為止。
  4.操作工將擦布放入飲用水中潤濕、擰干，將干燥機及攪拌罐外部擦洗一遍，邊擦邊用飲用水沖洗潔凈。
  3）沖洗：最后用高壓水槍將干燥機表面及攪拌罐內外徹底沖洗潔凈。
  1.將裝有純化水的不銹鋼桶放到出料口下，取干凈擦布蘸75%乙醇把出料口擦洗一遍，10分鐘后，將干凈擦布放到純化水中潤濕、擰干，再將干燥機出料口徹底擦拭潔凈并無醇味為止。
  2.對干燥機及控制柜的外壁、儀表的清潔用干凈濕抹布將干燥機及控制柜的外壁、各閥門、儀表擦潔凈，外表無污漬。
  3.在清洗過程中，特別留意出料口及攪拌罐放料閥的清洗。
  4）機身的干燥：翻開加熱器及風機，對整體設備停止干燥。
  1.關閉蝶閥5分鐘，再翻開蝶閥3分鐘，這樣連續二次，就可把旋風別離器水分去掉。
  2.干燥終了，關掉加熱器，當進風溫度降到50℃時，即可關閉風機。